Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB4AP20338 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB4AP20338 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB4AP20338 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB4AP20338 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB4AP20338 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB4AP20338 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB4AP20338 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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RAB4AP20338 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RAB4AP20338 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RAB4AP20338 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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