Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DESP17661 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DESP17661 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DESP17661 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms