Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF3P15923 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF3P15923 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCF3P15923 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms