Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYH1P12882 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYH1P12882 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MYH1P12882 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYH1P12882 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYH1P12882 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYH1P12882 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYH1P12882 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MYH1P12882 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms