Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TMEM225BP0DP42 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TMEM225BP0DP42 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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