Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC175P0C221 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC175P0C221 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC175P0C221 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC175P0C221 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC175P0C221 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC175P0C221 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC175P0C221 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC175P0C221 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms