Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOP08100 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOP08100 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOP08100 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOP08100 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms