Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRTO14522 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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