Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms