Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IGSF9BQ9UPX0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms