Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5BQ9UGL1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms