Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms