Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF275Q9NSD4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF275Q9NSD4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms