Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ASCL3Q9NQ33 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms