Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SLC6A20Q9NP91 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms