Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms