Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZYG11BQ9C0D3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZYG11BQ9C0D3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZYG11BQ9C0D3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms