Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SNHG12Q9BXW3 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms