Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF17Q9BXT8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms