Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SSBP4Q9BWG4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms