Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCDC32Q9BV29 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCDC32Q9BV29 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCDC32Q9BV29 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCDC32Q9BV29 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCDC32Q9BV29 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CCDC32Q9BV29 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CCDC32Q9BV29 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms