Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SPOCK3Q9BQ16 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms