Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAT1Q99536 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms