Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SORT1Q99523 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SORT1Q99523 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SORT1Q99523 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SORT1Q99523 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SORT1Q99523 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SORT1Q99523 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SORT1Q99523 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms