Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SAMD8Q96LT4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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SAMD8Q96LT4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SAMD8Q96LT4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SAMD8Q96LT4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SAMD8Q96LT4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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SAMD8Q96LT4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SAMD8Q96LT4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SAMD8Q96LT4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SAMD8Q96LT4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SAMD8Q96LT4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAMD8Q96LT4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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