Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY7

MTBP, Mdm2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 904 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTBPQ96DY7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MTBPQ96DY7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTBPQ96DY7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms