Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms