Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG2BQ96BY7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG2BQ96BY7 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms