Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBLCP1Q8WVY7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms