Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNAAF3Q8N9W5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms