Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms