Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RUFY3Q7L099 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RUFY3Q7L099 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms