Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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USP43Q70EL4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
USP43Q70EL4 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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