Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms