Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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