Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PCAT18-201ENST00000579458 2598 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
C16orf54Q6UWD8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms