Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF549Q6P9A3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF549Q6P9A3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF549Q6P9A3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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