Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
LRRC8EQ6NSJ5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms