Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATG16L1Q676U5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms