Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM46CQ5VWP2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms