Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DCAF6Q58WW2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DCAF6Q58WW2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms