Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ASPRV1Q53RT3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms