Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HSD17B12Q53GQ0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms