Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT8

KBTBD12, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD12Q3ZCT8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KBTBD12Q3ZCT8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms