Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL38Q2WGJ6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms