Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC142Q17RM4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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