Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PFKFB3Q16875 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PFKFB3Q16875 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PFKFB3Q16875 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PFKFB3Q16875 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PFKFB3Q16875 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PFKFB3Q16875 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms