Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RTN1Q16799 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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