Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms