Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HIF1AQ16665 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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